Protein–RNA interactions for Protein: Q810L4

Tmem39b, Transmembrane protein 39B, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem39bQ810L4 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem39bQ810L4 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tmem39bQ810L4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms