Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Atg2bQ80XK6 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Atg2bQ80XK6 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms