Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Ttc28Q80XJ3 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc28Q80XJ3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc28Q80XJ3 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc28Q80XJ3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc28Q80XJ3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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Ttc28Q80XJ3 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc28Q80XJ3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc28Q80XJ3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc28Q80XJ3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc28Q80XJ3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ttc28Q80XJ3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ttc28Q80XJ3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms