Protein–RNA interactions for Protein: Q7TT28

Rexo1, RNA exonuclease 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo1Q7TT28 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Rexo1Q7TT28 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rexo1Q7TT28 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rexo1Q7TT28 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms