Protein–RNA interactions for Protein: Q7TST5

Lamp3, Lysosome-associated membrane glycoprotein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamp3Q7TST5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Lamp3Q7TST5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Lamp3Q7TST5 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms