Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prrc2aQ7TSC1 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prrc2aQ7TSC1 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms