Protein–RNA interactions for Protein: Q7TS58

Clec4b1, Antigen presenting cell lectin-like receptor A2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clec4b1Q7TS58 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Clec4b1Q7TS58 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Clec4b1Q7TS58 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms