Protein–RNA interactions for Protein: Q7TQK5

Ccdc93, Coiled-coil domain-containing protein 93, mousemouse

Predictions only

Length 629 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc93Q7TQK5 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ccdc93Q7TQK5 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ccdc93Q7TQK5 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms