Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Smap2Q7TN29 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Smap2Q7TN29 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms