Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMI3

Uhrf2, E3 ubiquitin-protein ligase UHRF2, mousemouse

Predictions only

Length 803 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf2Q7TMI3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Uhrf2Q7TMI3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Uhrf2Q7TMI3 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Uhrf2Q7TMI3 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Uhrf2Q7TMI3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms