Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMB3

Ppp1r3c, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 3C, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r3cQ7TMB3 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ppp1r3cQ7TMB3 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ppp1r3cQ7TMB3 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms