Protein–RNA interactions for Protein: Q7M750

Opalin, Opalin, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OpalinQ7M750 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
OpalinQ7M750 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
OpalinQ7M750 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms