Protein–RNA interactions for Protein: Q78T54

Vma21, Vacuolar ATPase assembly integral membrane protein Vma21, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vma21Q78T54 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Vma21Q78T54 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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Vma21Q78T54 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vma21Q78T54 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
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Vma21Q78T54 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Vma21Q78T54 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Vma21Q78T54 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
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