Protein–RNA interactions for Protein: Q78JN3

Eci3, Enoyl-CoA delta isomerase 3, peroxisomal, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eci3Q78JN3 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eci3Q78JN3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eci3Q78JN3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eci3Q78JN3 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eci3Q78JN3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Eci3Q78JN3 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Eci3Q78JN3 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Eci3Q78JN3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms