Protein–RNA interactions for Protein: Q76LS9

Mindy1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-1, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mindy1Q76LS9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Mindy1Q76LS9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.95
Mindy1Q76LS9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mindy1Q76LS9 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mindy1Q76LS9 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mindy1Q76LS9 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mindy1Q76LS9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mindy1Q76LS9 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mindy1Q76LS9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Mindy1Q76LS9 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms