Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZWV7

Rpl35, 60S ribosomal protein L35, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl35Q6ZWV7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Rpl35Q6ZWV7 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Rpl35Q6ZWV7 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms