Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ58

Larp1, La-related protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,072 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1Q6ZQ58 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Larp1Q6ZQ58 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Larp1Q6ZQ58 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Larp1Q6ZQ58 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Larp1Q6ZQ58 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms