Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQ18

Efr3b, Protein EFR3 homolog B, mousemouse

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Length 817 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efr3bQ6ZQ18 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
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Efr3bQ6ZQ18 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
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Efr3bQ6ZQ18 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Efr3bQ6ZQ18 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
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Efr3bQ6ZQ18 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Efr3bQ6ZQ18 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
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Efr3bQ6ZQ18 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Efr3bQ6ZQ18 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
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Efr3bQ6ZQ18 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Efr3bQ6ZQ18 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
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Efr3bQ6ZQ18 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
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Efr3bQ6ZQ18 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Efr3bQ6ZQ18 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms