Protein–RNA interactions for Protein: Q6X893

Slc44a1, Choline transporter-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 653 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc44a1Q6X893 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Slc44a1Q6X893 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Slc44a1Q6X893 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc44a1Q6X893 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms