Protein–RNA interactions for Protein: Q6UJY2

Slc9c1, Sodium/hydrogen exchanger 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc9c1Q6UJY2 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Slc9c1Q6UJY2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Slc9c1Q6UJY2 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms