Protein–RNA interactions for Protein: Q6QD59

Bnip1, Vesicle transport protein SEC20, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bnip1Q6QD59 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Bnip1Q6QD59 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Bnip1Q6QD59 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Bnip1Q6QD59 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms