Protein–RNA interactions for Protein: Q6PFD9

Nup98, Nuclear pore complex protein Nup98-Nup96, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,816 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup98Q6PFD9 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Nup98Q6PFD9 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Olfr718-ps1-204ENSMUST00000218872 963 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nup98Q6PFD9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms