Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS0

Vstm2l, V-set and transmembrane domain-containing protein 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vstm2lQ6PDS0 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vstm2lQ6PDS0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vstm2lQ6PDS0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms