Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDF3

Svopl, Putative transporter SVOPL, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SvoplQ6PDF3 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
SvoplQ6PDF3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
SvoplQ6PDF3 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
SvoplQ6PDF3 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms