Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDC0

Rundc3b, RUN domain-containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc3bQ6PDC0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Rundc3bQ6PDC0 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Rundc3bQ6PDC0 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.3 ms