Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCY5

Gm2163, 4933409K07Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2163Q6PCY5 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Gm2163Q6PCY5 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gm2163Q6PCY5 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gm2163Q6PCY5 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms