Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3B2

Ubald1, UBA-like domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubald1Q6P3B2 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Ubald1Q6P3B2 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubald1Q6P3B2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubald1Q6P3B2 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubald1Q6P3B2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubald1Q6P3B2 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubald1Q6P3B2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ubald1Q6P3B2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms