Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gpbp1l1Q6NZP2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms