Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXN1

Szrd1, SUZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Szrd1Q6NXN1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Szrd1Q6NXN1 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Szrd1Q6NXN1 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms