Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF9

Cpsf6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 551 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpsf6Q6NVF9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Cpsf6Q6NVF9 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Cpsf6Q6NVF9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms