Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVF4

Helb, DNA helicase B, mousemouse

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HelbQ6NVF4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
HelbQ6NVF4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Mroh6-201ENSMUST00000184858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
HelbQ6NVF4 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms