Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW3

Sphkap, A-kinase anchor protein SPHKAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,687 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SphkapQ6NSW3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.12
SphkapQ6NSW3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
SphkapQ6NSW3 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
SphkapQ6NSW3 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.2 ms