Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQX2

Nckap5l, Nck-associated protein 5-like, mousemouse

Predictions only

Length 1,323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nckap5lQ6GQX2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Nckap5lQ6GQX2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Nckap5lQ6GQX2 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Nckap5lQ6GQX2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms