Protein–RNA interactions for Protein: Q6GQU0

UPF0524 protein C3orf70 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q6GQU0 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Q6GQU0 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6GQU0 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6GQU0 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6GQU0 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Q6GQU0 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms