Protein–RNA interactions for Protein: Q6EBV9

Atg9b, Autophagy-related protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 922 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg9bQ6EBV9 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Atg9bQ6EBV9 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Atg9bQ6EBV9 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms