Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Nop58Q6DFW4 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Nop58Q6DFW4 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms