Protein–RNA interactions for Protein: Q6A009

Ltn1, E3 ubiquitin-protein ligase listerin, mousemouse

Predictions only

Length 1,767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltn1Q6A009 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ltn1Q6A009 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ltn1Q6A009 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ltn1Q6A009 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms