Protein–RNA interactions for Protein: Q69Z26

Cntn4, Contactin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn4Q69Z26 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Cnn3-201ENSMUST00000029773 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Cntn4Q69Z26 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Cntn4Q69Z26 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms