Protein–RNA interactions for Protein: Q64HY3

Sp9, Transcription factor Sp9, mousemouse

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Length 484 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp9Q64HY3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
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Sp9Q64HY3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Sp9Q64HY3 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
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Sp9Q64HY3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Sp9Q64HY3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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Sp9Q64HY3 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Sp9Q64HY3 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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Sp9Q64HY3 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sp9Q64HY3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 179.9 ms