Protein–RNA interactions for Protein: Q64347

Clcn1, Chloride channel protein 1, mousemouse

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Length 994 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcn1Q64347 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Clcn1Q64347 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
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Clcn1Q64347 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
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Clcn1Q64347 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Clcn1Q64347 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms