Protein–RNA interactions for Protein: Q64282

Ifit1, Interferon-induced protein with tetratricopeptide repeats 1, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifit1Q64282 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Ifit1Q64282 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ifit1Q64282 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms