Protein–RNA interactions for Protein: Q640Q5

Pan3, PAN2-PAN3 deadenylation complex subunit Pan3, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pan3Q640Q5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Pan3Q640Q5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pan3Q640Q5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47 ms