Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW6

Col4a5, Col4a5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a5Q63ZW6 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Col4a5Q63ZW6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Col4a5Q63ZW6 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms