Protein–RNA interactions for Protein: Q63955

Pou4f3, POU domain, class 4, transcription factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou4f3Q63955 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Pou4f3Q63955 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pou4f3Q63955 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms