Protein–RNA interactions for Protein: Q62507

Coch, Cochlin, mousemouse

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CochQ62507 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
CochQ62507 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
CochQ62507 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CochQ62507 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CochQ62507 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
CochQ62507 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CochQ62507 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CochQ62507 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
CochQ62507 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CochQ62507 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CochQ62507 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
CochQ62507 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
CochQ62507 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CochQ62507 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CochQ62507 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
CochQ62507 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CochQ62507 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CochQ62507 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
CochQ62507 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CochQ62507 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CochQ62507 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CochQ62507 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CochQ62507 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CochQ62507 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
CochQ62507 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.2 ms