Protein–RNA interactions for Protein: Q62471

Lcn3, Vomeronasal secretory protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lcn3Q62471 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Lcn3Q62471 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lcn3Q62471 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms