Protein–RNA interactions for Protein: Q62468

Vil1, Villin-1, mousemouse

Predictions only

Length 827 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vil1Q62468 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vil1Q62468 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vil1Q62468 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vil1Q62468 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms