Protein–RNA interactions for Protein: Q62383

Supt6h, Transcription elongation factor SPT6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Supt6hQ62383 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Supt6hQ62383 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Supt6hQ62383 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Supt6hQ62383 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms