Protein–RNA interactions for Protein: Q62141

Sin3b, Paired amphipathic helix protein Sin3b, mousemouse

Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sin3bQ62141 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Sin3bQ62141 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Sin3bQ62141 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms