Protein–RNA interactions for Protein: Q61539

Esrrb, Steroid hormone receptor ERR2, mousemouse

Predictions only

Length 433 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EsrrbQ61539 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
EsrrbQ61539 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
EsrrbQ61539 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms